Разрабатывается РКК «Энергия». Отличается от «Союзов» многоразовостью и возможностью вывода на орбиту большего количества людей и груза. Также «Клипер» имеет возвращаемую капсулу и больший внутренний объём для комфорта и автономного полёта. Корабль может использоваться для разных задач: доставки экипажа и груза на орбиту, эвакуации экипажа.
Разработка «Клипера» не была приоритетной для РКК «Энергия», финансирование проекта осуществлялось из собственных средств корпорации, не получив поддержки от Европы. В итоге был проведён второй конкурс на новый российский корабль, победитель — РКК «Энергия».