Большинство экспертов сходятся во мнении, что Тутанхамон был сыном Эхнатона. Однако вопрос о том, кто была его матерью, остаётся открытым.

Известно, что у Эхнатона было две жены: Нефертити и Кий. О первой известно больше, чем о второй. Нефертити была найдена в гробнице KV35. В 2010 году исследование ДНК показало, что матерью Тутанхамона была женщина, чей саркофаг также обнаружили в этой гробнице. По мнению исследователей, эта женщина была дочерью Аменхотепа III, то есть сестрой Эхнатона.

Однако этот вывод не является окончательным, поскольку цари XVIII династии часто женились на своих двоюродных сёстрах. Кроме того, родственные гены родителей могут усложнить понимание генетической картины у потомков. Поэтому мы до сих пор не знаем точно, кто была эта «молодая женщина» — Нефертити, Кий или какая-то другая жена Эхнатона.